尖銳濕疣初期疣體較少的時候治療上主要以局部治療為主,可以使用鬼臼毒素酊,是抗有絲分裂的藥,能夠破壞疣體,每天兩次外用,連用三天,停藥四天為一個療程,有必要的時候可以重復治療達四個療程。治愈率有達到86%至93%,但是有致畸的作用,孕婦是禁用的。另外還有可以使用三氯醋酸或二氯醋酸溶液,都是一種腐蝕劑,通過對蛋白的化學凝固作用而破壞疣體,使疣組織壞死、干固和脫落,每一到兩周一次外用,連續(xù)用藥不超過六次。
另外,常用的還有咪喹莫特,為局部外用免疫調(diào)節(jié)藥,刺激局部產(chǎn)生干擾素和其他細胞因子,每天晚上睡前外用,每周三次,用藥六到十個小時后清洗掉,可用十六周,通常八到十周疣體脫落。