藥物流產危害是否大應根據具體的情況進行判斷，如果是在妊娠49天以內進行藥物流產，危害通常不大，如果是在妊娠49天以后進行藥物流產，危害通常大，需要根據具體的情況，在醫(yī)生的指導下確定流產的方式以及時間。
如果孕婦由于個人體質原因或者胚胎發(fā)育不良，需要終止妊娠，則可以在醫(yī)生的建議下進行藥物流產，藥物流產是指遵醫(yī)囑服用米非司酮片和米索前列醇片終止早期妊娠，如果是在妊娠49天以內在醫(yī)生的指導下進行藥物流產，危害通常不大，通常不會引起嚴重的宮腔感染，也不會對子宮內膜造成嚴重的損傷。
如果妊娠的時間比較長，錯過了較佳的時間，危害會比較大，因為胎兒可能已經初具人形，也有可能已經長出了骨骼，此時再進行藥物流產，可能會引起嚴重的出血，還會造成流產不全，部分胚胎和胎盤組織可能仍留在子宮內，引起持續(xù)性的出血或感染，這種情況下可能需要通過清宮術進行治療，會導致子宮內膜受到嚴重的損傷，其次還有可能會影響內分泌系統(tǒng)，有可能會引起月經紊亂，還有可能會引起排卵異常，影響女性的生育能力。
進行藥物流產后需要保持陰部的清潔和干燥，還需要遵醫(yī)囑定期去醫(yī)院進行B超檢查，了解恢復情況。
